Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL19A1Q14993 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL19A1Q14993 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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