Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SNAPC2Q13487 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNAPC2Q13487 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAPC2Q13487 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms