Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MKRN4PQ13434 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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