Protein–RNA interactions for Protein: Q13418

ILK, Integrin-linked protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKQ13418 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ILKQ13418 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ILKQ13418 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ILKQ13418 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ILKQ13418 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ILKQ13418 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ILKQ13418 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ILKQ13418 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ILKQ13418 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ILKQ13418 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ILKQ13418 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ILKQ13418 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ILKQ13418 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ILKQ13418 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ILKQ13418 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ILKQ13418 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ILKQ13418 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ILKQ13418 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ILKQ13418 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ILKQ13418 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ILKQ13418 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms