Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)27.54■■■□□ 24e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 526.88■■□□□ 1.894e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 226.88■■□□□ 1.894e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 525.41■■□□□ 1.664e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 523.14■■□□□ 1.294e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 518.77■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 310.54□□□□□ -0.724e-8■■■□□ 19.1
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G3BP1Q13283 KRT19-207ENST00000593096 728 ntTSL 319.4■□□□□ 0.73e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 FLNA-218ENST00000498491 914 ntTSL 521.71■■□□□ 1.071e-9■■■□□ 19.1
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G3BP1Q13283 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.432e-9■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.842e-9■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-9■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 AC097637.1-202ENST00000478201 570 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-9■■■□□ 19.1
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G3BP1Q13283 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.349e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.639e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 MCM7-204ENST00000425308 1497 ntTSL 334.94■■■■□ 3.187e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 514.89□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 215.66■□□□□ 0.14e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.024e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.284e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 PRDX2-205ENST00000478908 413 ntTSL 213.67□□□□□ -0.227e-8■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.121e-6■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 CAP1-217ENST00000461993 856 ntTSL 25.32□□□□□ -1.561e-9■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■■□□ 19.1
G3BP1Q13283 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■■□□ 19.1
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G3BP1Q13283 AKR1C3-201ENST00000380554 1807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 GLDC-221ENST00000640592 2828 ntTSL 59.33□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 19
G3BP1Q13283 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 316.69■□□□□ 0.263e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.073e-6■■■□□ 19
G3BP1Q13283 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 19
G3BP1Q13283 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 19
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G3BP1Q13283 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.832e-6■■■□□ 19
G3BP1Q13283 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-6■■■□□ 19
G3BP1Q13283 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 19
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G3BP1Q13283 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 210.3□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 19
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G3BP1Q13283 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 315.05■□□□□ -01e-8■■■□□ 19
G3BP1Q13283 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 314.86□□□□□ -0.031e-8■■■□□ 19
G3BP1Q13283 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 514.08□□□□□ -0.161e-8■■■□□ 19
G3BP1Q13283 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-7■■■□□ 19
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G3BP1Q13283 QARS-241ENST00000635375 947 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 19
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G3BP1Q13283 QARS-230ENST00000634527 732 ntTSL 513.41□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 QARS-213ENST00000470619 876 ntTSL 412.77□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 QARS-206ENST00000452739 1044 ntTSL 512.64□□□□□ -0.393e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 PRPF8-213ENST00000576407 566 ntTSL 210.58□□□□□ -0.724e-7■■■□□ 19
G3BP1Q13283 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.51e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 AIFM2-203ENST00000482166 952 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 318.6■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 221.76■■□□□ 1.072e-10■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.181e-17■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-9■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 MAP2K1-203ENST00000566326 1432 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-9■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.093e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.815e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.015e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 IDH1-202ENST00000415282 942 ntTSL 221.55■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 EIF3G-213ENST00000593054 453 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.423e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 224.8■■□□□ 1.562e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 MCM2-202ENST00000468414 1076 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 TGM2-204ENST00000468262 1862 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 18.9
G3BP1Q13283 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 18.8
G3BP1Q13283 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 215.74■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 18.8
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