RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425308.5

MCM7-204, Transcript of minichromosome maintenance complex component 7, humanhuman

TSL 3

Gene MCM7, Length 1,497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM7-204ENST00000425308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.12■■■■■ 8.34
MCM7-204ENST00000425308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.47■■■■■ 7.11
MCM7-204ENST00000425308 ABCC9O60706 1549 aa57.36■■■■■ 6.77
MCM7-204ENST00000425308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.09■■■■■ 6.57
MCM7-204ENST00000425308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.71■■■■■ 6.51
MCM7-204ENST00000425308 NACADO15069 1562 aa55.68■■■■■ 6.5
MCM7-204ENST00000425308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.61■■■■■ 6.49
MCM7-204ENST00000425308 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.58■■■■■ 6.49
MCM7-204ENST00000425308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.58■■■■■ 6.49
MCM7-204ENST00000425308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.35■■■■■ 6.29
MCM7-204ENST00000425308 SCRIBQ14160 1630 aa54.26■■■■■ 6.28
MCM7-204ENST00000425308 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.8■■■■■ 6.2
MCM7-204ENST00000425308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.65■■■■■ 6.183e-6■■■■□ 23.3
MCM7-204ENST00000425308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.4■■■■■ 6.14
MCM7-204ENST00000425308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
MCM7-204ENST00000425308 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.15■■■■■ 5.94
MCM7-204ENST00000425308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.03■■■■■ 5.92
MCM7-204ENST00000425308 SMARCA4P51532 1647 aa51.97■■■■■ 5.91
MCM7-204ENST00000425308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.96■■■■■ 5.91
MCM7-204ENST00000425308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.84■■■■■ 5.89
MCM7-204ENST00000425308 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.72■■■■■ 5.87
MCM7-204ENST00000425308 SMARCA2P51531 1590 aa51.5■■■■■ 5.83
MCM7-204ENST00000425308 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.45■■■■■ 5.83
MCM7-204ENST00000425308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.44■■■■■ 5.83
MCM7-204ENST00000425308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.38■■■■■ 5.82
MCM7-204ENST00000425308 NCAPD3P42695 1498 aa51.31■■■■■ 5.8
MCM7-204ENST00000425308 WIZO95785 1651 aa51.24■■■■■ 5.79
MCM7-204ENST00000425308 HMGXB3Q12766 1538 aa51.2■■■■■ 5.79
MCM7-204ENST00000425308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.12■■■■■ 5.77
MCM7-204ENST00000425308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
MCM7-204ENST00000425308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
MCM7-204ENST00000425308 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.1■■■■■ 5.61
MCM7-204ENST00000425308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.91■■■■■ 5.58
MCM7-204ENST00000425308 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.85■■■■■ 5.57
MCM7-204ENST00000425308 NESP48681 1621 aa49.83■■■■■ 5.57
MCM7-204ENST00000425308 CFTRP13569 1480 aa49.73■■■■■ 5.55
MCM7-204ENST00000425308 PRDM2Q13029 1718 aa49.55■■■■■ 5.52
MCM7-204ENST00000425308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.51■■■■■ 5.52
MCM7-204ENST00000425308 ERCC6Q03468 1493 aa49.44■■■■■ 5.51
MCM7-204ENST00000425308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.36■■■■■ 5.49
MCM7-204ENST00000425308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.31■■■■■ 5.48
MCM7-204ENST00000425308 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.21■■■■■ 5.47
MCM7-204ENST00000425308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49■■■■■ 5.44
MCM7-204ENST00000425308 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.98■■■■■ 5.43
MCM7-204ENST00000425308 WDR62O43379 1518 aa48.8■■■■■ 5.4
MCM7-204ENST00000425308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
MCM7-204ENST00000425308 ABCC8Q09428 1581 aa48.68■■■■■ 5.38
MCM7-204ENST00000425308 CUX2O14529 1486 aa48.65■■■■■ 5.38
MCM7-204ENST00000425308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.65■■■■■ 5.38
MCM7-204ENST00000425308 TOPBP1Q92547 1522 aa48.6■■■■■ 5.37
MCM7-204ENST00000425308 CUX1P39880 1505 aa48.49■■■■■ 5.35
MCM7-204ENST00000425308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.47■■■■■ 5.35
MCM7-204ENST00000425308 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.33■■■■■ 5.33
MCM7-204ENST00000425308 TOP2BQ02880 1626 aa48.32■■■■■ 5.33
MCM7-204ENST00000425308 SYNJ1O43426 1573 aa48.32■■■■■ 5.33
MCM7-204ENST00000425308 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
MCM7-204ENST00000425308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.23■■■■■ 5.31
MCM7-204ENST00000425308 IFT140Q96RY7 1462 aa48.13■■■■■ 5.3
MCM7-204ENST00000425308 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
MCM7-204ENST00000425308 SOGA1O94964 1423 aa48.03■■■■■ 5.28
MCM7-204ENST00000425308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.98■■■■■ 5.27
MCM7-204ENST00000425308 WDR97A6NE52 1622 aa47.86■■■■■ 5.25
MCM7-204ENST00000425308 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.81■■■■■ 5.24
MCM7-204ENST00000425308 TRIM41Q8WV44 630 aa47.79■■■■■ 5.24
MCM7-204ENST00000425308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.79■■■■■ 5.24
MCM7-204ENST00000425308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
MCM7-204ENST00000425308 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
MCM7-204ENST00000425308 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.63■■■■■ 5.22
MCM7-204ENST00000425308 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.61■■■■■ 5.212e-7■■■■■ 46.2
MCM7-204ENST00000425308 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.58■■■■■ 5.21
MCM7-204ENST00000425308 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.51■■■■■ 5.2
MCM7-204ENST00000425308 PBRM1Q86U86 1689 aa47.45■■■■■ 5.19
MCM7-204ENST00000425308 KIF27Q86VH2 1401 aa47.42■■■■■ 5.18
MCM7-204ENST00000425308 GRIN2BQ13224 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
MCM7-204ENST00000425308 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.28■■■■■ 5.16
MCM7-204ENST00000425308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.25■■■■■ 5.15
MCM7-204ENST00000425308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
MCM7-204ENST00000425308 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.11■■■■■ 5.13
MCM7-204ENST00000425308 ADAMTS12P58397 1594 aa47.09■■■■■ 5.13
MCM7-204ENST00000425308 CUL7Q14999 1698 aa47.05■■■■■ 5.12
MCM7-204ENST00000425308 IGF1RP08069 1367 aa47.04■■■■■ 5.12
MCM7-204ENST00000425308 SYNJ2O15056 1496 aa47.03■■■■■ 5.12
MCM7-204ENST00000425308 EEA1Q15075 1411 aa47.02■■■■■ 5.12
MCM7-204ENST00000425308 CHD1O14646 1710 aa47■■■■■ 5.12
MCM7-204ENST00000425308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.99■■■■■ 5.11
MCM7-204ENST00000425308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
MCM7-204ENST00000425308 FBLN2P98095 1184 aa46.9■■■■■ 5.1
MCM7-204ENST00000425308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.83■■■■■ 5.09
MCM7-204ENST00000425308 GRIN2AQ12879 1464 aa46.81■■■■■ 5.08
MCM7-204ENST00000425308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.76■■■■■ 5.08
MCM7-204ENST00000425308 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
MCM7-204ENST00000425308 OSCARQ8IYS5 282 aa46.7■■■■■ 5.07
MCM7-204ENST00000425308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.66■■■■■ 5.06
MCM7-204ENST00000425308 PRXQ9BXM0 1461 aa46.65■■■■■ 5.06
MCM7-204ENST00000425308 NUP160Q12769 1436 aa46.55■■■■■ 5.04
MCM7-204ENST00000425308 CEP170Q5SW79 1584 aa46.55■■■■■ 5.04
MCM7-204ENST00000425308 KIF21BO75037 1637 aa46.49■■■■■ 5.03
MCM7-204ENST00000425308 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.46■■■■■ 5.03
MCM7-204ENST00000425308 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.3■■■■■ 5
MCM7-204ENST00000425308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.28■■■■■ 5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms