Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKRN3Q13064 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN3Q13064 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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