Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIRE1Q08AE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIRE1Q08AE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms