Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REG3AQ06141 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
REG3AQ06141 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms