Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC63Q05C16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms