Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP2R2BQ00005 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP2R2BQ00005 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP2R2BQ00005 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms