Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS25P62851 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS25P62851 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS25P62851 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS25P62851 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS25P62851 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS25P62851 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS25P62851 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS25P62851 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS25P62851 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS25P62851 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS25P62851 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS25P62851 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms