Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL23P62829 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL23P62829 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL23P62829 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL23P62829 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL23P62829 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL23P62829 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL23P62829 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms