Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6P62753 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6P62753 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6P62753 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6P62753 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6P62753 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6P62753 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6P62753 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6P62753 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6P62753 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6P62753 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6P62753 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6P62753 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6P62753 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6P62753 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6P62753 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6P62753 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6P62753 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6P62753 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6P62753 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6P62753 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6P62753 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6P62753 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6P62753 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6P62753 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6P62753 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6P62753 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6P62753 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6P62753 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms