Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCD1P59942 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCD1P59942 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCD1P59942 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms