Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NXPH1P58417 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXPH1P58417 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPH1P58417 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms