Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RWDD2BP57060 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD2BP57060 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RWDD2BP57060 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms