Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSE1LP55060 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms