Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP5P51878 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP5P51878 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP5P51878 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP5P51878 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP5P51878 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP5P51878 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP5P51878 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP5P51878 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP5P51878 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP5P51878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP5P51878 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP5P51878 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP5P51878 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP5P51878 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP5P51878 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP5P51878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP5P51878 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP5P51878 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP5P51878 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.8 ms