Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCLCP48506 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCLCP48506 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCLCP48506 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCLCP48506 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCLCP48506 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GCLCP48506 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GCLCP48506 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCLCP48506 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCLCP48506 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCLCP48506 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLCP48506 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLCP48506 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLCP48506 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCLCP48506 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCLCP48506 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GCLCP48506 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLCP48506 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCLCP48506 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCLCP48506 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms