Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 PGU1YJR153W 1086 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SSP120YLR250W 705 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 RPS19BYNL302C 435 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 DAL82YNL314W 768 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YOR200WYOR200W 399 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MRL1YPR079W 1146 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 PSE1YMR308C 3270 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SNF3YDL194W 2655 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 ELP2YGR200C 2367 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 WTM2YOR229W 1404 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 ULA1YPL003W 1389 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 COS9YKL219W 1224 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 DCN1YLR128W 810 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MCM4YPR019W 2802 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 UBA2YDR390C 1911 nt5.34□□□□□ -1.55
SEC28P40509 PCL8YPL219W 1479 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 CBP1YJL209W 1965 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 LPL1YOR059C 1353 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 GLE2YER107C 1098 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 SYF2YGR129W 648 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YIR043CYIR043C 693 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 LEM3YNL323W 1245 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 CBC2YPL178W 627 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 NOT3YIL038C 2511 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YIL067CYIL067C 2037 nt5.33□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RSC30YHR056C 2652 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RTT106YNL206C 1368 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 ARP10YDR106W 855 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 DBP8YHR169W 1296 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YIL028WYIL028W 399 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 MND2YIR025W 1107 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YKR104WYKR104W 921 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RSA3YLR221C 663 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 CSR1YLR380W 1227 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 ROX3YBL093C 663 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 KTR3YBR205W 1215 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 DPH2YKL191W 1605 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 KIP2YPL155C 2121 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 MNN2YBR015C 1794 nt5.32□□□□□ -1.56
SEC28P40509 QDR1YIL120W 1692 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YDL172CYDL172C 480 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 GCS1YDL226C 1059 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YJL193WYJL193W 1209 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 MTC2YKL098W 1074 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 SMA1YPL027W 738 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 TIP41YPR040W 1071 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RET1YOR207C 3450 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RGT1YKL038W 3513 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YGL036WYGL036W 2730 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 UGA1YGR019W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 PDC1YLR044C 1692 nt5.31□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YJR115WYJR115W 510 nt5.3□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YOL035CYOL035C 303 nt5.3□□□□□ -1.56
SEC28P40509 RPT4YOR259C 1314 nt5.29□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YEL077CYEL077C 3834 nt5.29□□□□□ -1.56
SEC28P40509 FMP48YGR052W 1110 nt5.29□□□□□ -1.56
SEC28P40509 YGR122WYGR122W 1209 nt5.29□□□□□ -1.56
SEC28P40509 STE20YHL007C 2820 nt5.29□□□□□ -1.56
SEC28P40509 TOS4YLR183C 1470 nt5.28□□□□□ -1.56
SEC28P40509 MTW1YAL034W-A 870 nt5.28□□□□□ -1.56
SEC28P40509 PAU17YLL025W 375 nt5.28□□□□□ -1.56
SEC28P40509 SCO1YBR037C 888 nt5.28□□□□□ -1.56
SEC28P40509 APL6YGR261C 2430 nt5.28□□□□□ -1.56
SEC28P40509 DBF4YDR052C 2115 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 GIP2YER054C 1647 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 FPK1YNR047W 2682 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YLR122CYLR122C 378 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YLR346CYLR346C 306 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 OCA1YNL099C 717 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 PHA2YNL316C 1005 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SIA1YOR137C 1869 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ATH1YPR026W 3636 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 PEX19YDL065C 1029 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 UBC6YER100W 753 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 RMI1YPL024W 726 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ARH1YDR376W 1482 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ADY2YCR010C 852 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 MRF1YGL143C 1242 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 IPI1YHR085W 1005 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 CSL4YNL232W 879 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ERI1YPL096C-A 207 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SMP1YBR182C 1359 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 GSH2YOL049W 1476 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SIR2YDL042C 1689 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 VTC2YFL004W 2487 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SAP155YFR040W 3009 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SEC9YGR009C 1956 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 DIT1YDR403W 1611 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 SNM1YDR478W 597 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 RML2YEL050C 1182 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 CAX4YGR036C 720 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 EFM4YIL064W 774 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 CBF1YJR060W 1056 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 RPA49YNL248C 1248 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC28P40509 ARG1YOL058W 1263 nt5.24□□□□□ -1.57
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