Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7BP35670 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7BP35670 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP7BP35670 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ATP7BP35670 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ATP7BP35670 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATP7BP35670 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ATP7BP35670 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATP7BP35670 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms