Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDX3P30048 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX3P30048 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms