Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GTF2E1P29083 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF2E1P29083 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms