Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADLP28330 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADLP28330 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADLP28330 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADLP28330 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADLP28330 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADLP28330 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADLP28330 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADLP28330 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADLP28330 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADLP28330 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADLP28330 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADLP28330 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADLP28330 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADLP28330 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACADLP28330 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADLP28330 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADLP28330 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADLP28330 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms