Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB5P28074 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB5P28074 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms