Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA5P28066 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA5P28066 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA5P28066 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms