Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA1P17096 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGA1P17096 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms