Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTHFD1P11586 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTHFD1P11586 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms