Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L8P0C7I0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L8P0C7I0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L8P0C7I0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms