Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms