Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPP01282 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPP01282 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPP01282 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPP01282 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPP01282 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPP01282 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VIPP01282 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPP01282 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPP01282 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPP01282 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPP01282 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPP01282 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPP01282 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPP01282 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPP01282 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPP01282 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPP01282 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPP01282 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms