Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP3O75386 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP3O75386 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP3O75386 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP3O75386 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP3O75386 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP3O75386 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP3O75386 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP3O75386 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP3O75386 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP3O75386 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP3O75386 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP3O75386 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP3O75386 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP3O75386 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP3O75386 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TULP3O75386 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP3O75386 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP3O75386 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TULP3O75386 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TULP3O75386 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TULP3O75386 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TULP3O75386 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP3O75386 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP3O75386 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP3O75386 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP3O75386 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TULP3O75386 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP3O75386 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TULP3O75386 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP3O75386 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TULP3O75386 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TULP3O75386 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms