Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms