Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDF1O60869 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDF1O60869 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDF1O60869 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDF1O60869 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDF1O60869 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDF1O60869 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDF1O60869 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDF1O60869 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDF1O60869 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDF1O60869 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms