Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCO2O43819 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCO2O43819 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCO2O43819 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCO2O43819 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCO2O43819 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCO2O43819 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCO2O43819 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCO2O43819 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCO2O43819 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCO2O43819 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCO2O43819 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCO2O43819 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCO2O43819 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCO2O43819 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCO2O43819 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCO2O43819 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCO2O43819 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCO2O43819 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCO2O43819 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCO2O43819 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCO2O43819 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCO2O43819 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCO2O43819 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCO2O43819 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCO2O43819 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCO2O43819 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCO2O43819 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCO2O43819 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCO2O43819 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCO2O43819 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCO2O43819 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCO2O43819 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCO2O43819 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms