Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCP110O43303 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCP110O43303 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCP110O43303 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCP110O43303 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCP110O43303 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCP110O43303 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCP110O43303 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCP110O43303 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCP110O43303 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCP110O43303 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCP110O43303 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCP110O43303 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCP110O43303 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCP110O43303 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms