Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ST8SIA3O43173 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ST8SIA3O43173 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ST8SIA3O43173 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms