Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC3O15379 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms