Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD1B0YJ81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD1B0YJ81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms