Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1P1A8MUH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZK1P1A8MUH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms