Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf47A7E2U8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4orf47A7E2U8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms