Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RIMBP3BA6NNM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RIMBP3BA6NNM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RIMBP3BA6NNM3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RIMBP3BA6NNM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms