Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01549A6NIU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms