Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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