Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL4A3BPQ9Y5P4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL4A3BPQ9Y5P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A3BPQ9Y5P4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL4A3BPQ9Y5P4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms