Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8A1Q9Y2Q0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms