Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOD1Q9Y239 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOD1Q9Y239 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms