Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB23Q9ULC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB23Q9ULC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms