Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CABP1Q9NZU7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CABP1Q9NZU7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CABP1Q9NZU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CABP1Q9NZU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CABP1Q9NZU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CABP1Q9NZU7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CABP1Q9NZU7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms